L’AFÉE est composée de membres actifs, de membres bienfaiteurs et de membres d’honneur. Les membres actifs et les membres bienfaiteurs peuvent être individuels ou une personne morale.
L’adhésion à l’AFÉE est ouverte à toute personne physique ou morale relevant de l’enseignement supérieur et de la recherche.
Les autres personnes morales et physiques consacrant une part importante de leur activité professionnelle aux disciplines juridiques, économiques, historiques, politiques et de gestion concernant l’Europe peuvent être admis comme membres actifs par décision du Conseil d’Administration
Sont reconnus membres bienfaiteurs les personnes morales ou physiques qui participent à l’association par des dons ou par mécénat.
L’AFÉE est gérée par son Président, le Conseil d’administration et l’Assemblée générale composée de tous les membres de AFÉE.