Le soutien de la Commission européenne à l’action de l’AFEE  depuis sa création en 1965 sous l’appellation CEDECE ne s’est jamais démenti. Cette dernière bénéficie depuis plus de dix ans de l’action “Jean Monnet” et son activité est labellisée comme telle. L’AFEE se manifeste aujourd’hui encore comme un intermédiaire privilégié des institutions de l’Union européenne dans le dialogue que celles-ci nouent avec le monde universitaire français,  Par ailleurs, elle assure un relais solide de la politique d’appui à la recherche européenne que la Commission met en œuvre. Enfin, elle entretient avec ses homologues en Europe et au delà des relations constantes de travail ; ce qui lui vaut un rayonnement qui dépasse les frontières hexagonales.